Всички знаем, че водородният прекис обикновено се използва за медицинска, военна, и ежедневна дезинфекция. Въпреки това, промишленият водороден прекис има още една употреба, т.е. той се използва за контрол на замърсяването на водата. Въпреки това, като оксидант, водороден прекис се използва за замърсяване на водата. Каква е ползата?
Тъй като промишленият водороден прекис съдържа главно хидроксид и натриеви йони, хидроксидът може да се комбинира с много видове метални йони, за да образува флоци или утаители. Например, както всички знаем, канализацията съдържа метални йони като алуминиеви йони или железни йони, силни киселинни соли и слаби киселинни соли и т.н., които реагират с хидроксидни йони за производство на флоци или неразтворими утайки. Принципът на флокулация е основно да се комбинира с хидроксида в канализацията, за да образува флокулентни вещества за постигане на флокулация ефект. Той може също така да премахне излишните киселинни йони в промишлените канализации, като Cl-(SO4)2-(PO4)3 и др. Също така често се използва за регулиране на стойността на рН, а дозировката на промишления водороден прекис се определя според рН.
Опазването на околната среда може да третира всички видове вредни отпадъчни води, включително детоксикация, дезодориране, и обезцветяване, особено подходящ за пречистване на отпадъчни води на серни съединения, цианид, и феноли. Може да се използва самостоятелно или в комбинация с озон или UV светлина. Използването на водороден пероксид за пречистване на почвата, замърсена от изтекло гориво или друга органична материя, може да стимулира regrowth на микроорганизми, влошени замърсители, и да третира отпадъчния газ, съдържащ NOx, SO2, H2S и др., които могат да генерират полезна концентрирана азотна киселина и концентрирана сярна киселина. Водородният прекис също така подобрява способността на биохимичните процеси за третиране на отпадъчните води и предотвратява групирането на утайки. Когато отпадъчните води се третират, активният въглерод, използван в отпадъчния газ, може да бъде регенериран с водороден прекис.